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Os padrões de distribuição dos polimorfismos foram analisados, sendo considerada
a variação temporal e/ou geográfica das suas formas alélicas. Constatou-se grande
diversidade genotípica entre os isolados de
P. jirovecii
que poderá ter influência a
nível epidemiológico.
Foram observadas associações estatísticas entre
mt85
/genótipos
multilocus
e parâmetros demográficos e clínicos. A correlação mais
importante verificou-se entre
mt85C
e cargas parasitárias baixas a moderadas,
enquanto
mt85T
foi associado com cargas parasitárias altas; MLG5, MLG9 e
MLG13 foram associados com cargas parasitárias baixas, moderadas e altas,
respectivamente. Tais associações demonstram que potenciais marcadores
moleculares da infecção por
P. jirovecii
poderão existir e que
polimorfismos/genótipos específicos poderão determinar perfis epidemiológicos da
pneumonia por
Pneumocystis
.
A análise genética cruzada permitiu verificar
associações entre
polimorfismos de base única
. Os polimorfismos
SOD110T
e
SOD215C
,
SOD110C
e
SOD215T
,
DHPS165A
e
DHPS171C
,
DHPS165G
e
DHPS171T
foram associados estatisticamente. Os genótipos
multilocus
mais
prevalentes foram considerados para o teste recombinatório d1. Dois genótipos
multilocus
(MLG7 e MLG9) foram observados com elevada frequência, e a análise
genética indicou que estes se encontravam sobre-representados na população de
P. jirovecii
estudada. Estas evidências indicam que o fenómeno de desequilíbrio de
ligação e a propagação clonal de subtipos genéticos é frequente, considerando que
a espécie
P. jirovecii
poderá ser representada por uma população com estrutura
epidémica. O presente trabalho confirmou a importância do estudo de polimorfismos
em
P. jirovecii
, sugerindo que a caracterização
multilocus
poderá fornecer
informação relevante para a compreensão dos padrões, causas e controlo da
infecção, melhorando assim a investigação deste importante patogéneo.
FERREIRA, Daniela (2013) Sequenciação e análise do genoma de um
presumível flavivírus isolado de Aedes (Ochlerotatus) caspius,
Dissertação de Mestrado em Ciências Biomédicas, IHMT, Lisboa
O género
Flavivirus
(
Flaviviridae
) inclui mais de setenta vírus com genoma a RNA
de cadeia simples, muitos dos quais são importantes agentes patogénicos para o
Homem e os outros animais. A maioria dos flavivírus podem ser transmitidos por
carraças, mosquitos ou, aparentemente, restringir-se a vertebrados (Cook e Holmes,
2006). No entanto, um grupo de flavivírus designados “não clássicos”, não parece
ter hospedeiro vertebrado conhecido. Estes últimos são comumente colocados junto
à raiz de árvores filogenéticas do género
Flavivirus
, sendo frequentemente isolados
em mosquitos, justificando a sua designação de vírus específicos de insectos (ISF,
do inglês
insect-specific flaviviruses
) (Farfan-Ale
et al
., 2009). A classificação dos